В пункте 15.5 ПДД сказано:

При движении в направлении зеленой стрелки, включенной в дополнительной секции одновременно с желтым или красным сигналом светофора, водитель транспортного средства должен уступить дорогу транспортным средствам, движущимся с других направлений.

В данном случае водитель автомобиля обязан уступить дорогу мотоциклисту, т.к. движется в направлении зеленой стрелки, включенной в дополнительной секции.